进行生殖器官标本的细菌学检查，对临床诊断、鉴别性病或排除性病细菌感染非常有价值。
涂片未找到革兰阴性双球菌，培养未检出淋病奈瑟菌。
阳性分泌物直接涂片发现细胞内外有革兰阴性双球菌，形似淋病奈瑟菌时，患者有典型的临床症状，即可做出淋病的初步诊断。如双球菌不在细胞内则属于可疑，但应注意淋病早期时淋病奈瑟菌大多都集中在细胞外，随后才能在细胞内出现。患者在急性期时有大量的脓性分泌物，伴有尿道口或阴道充血水肿，男性患者具有确诊意义，而女性患者的诊断则应慎重，应结合临床或培养结果予以诊断。如果培养出淋病奈瑟菌，则即可确诊为淋病。