厌氧菌感染是一种内源性感染，病种遍及临床各科，人体的各个部位，各种器官均可发生厌氧菌感染。厌氧菌检测就是检测感染部位有无厌氧菌。
无厌氧细菌生长。
阳性：
中枢神经系统：脑脓肿、脑膜炎、硬脑膜下水肿。口腔与牙齿：齿龈感染、牙周炎。
耳鼻咽喉：中耳炎、鼻窦炎、扁桃体脓肿。
胸肺：吸入性肺炎、肺脓肿、胸膜炎。
腹内：阑尾炎、肝脓肿、盆腔炎。
女性生殖系统：产后感染、卵巢及输卵管脓肿、妇科手术后感染。
骨和关节：骨髓炎、化脓性关节炎。
心血管系统：菌血症、心内膜炎。软组织：蜂窝组织炎、慢性脓肿。